Funkcjonalność mKsięgowość nie obejmuje wystawiania poniższych faktur:
- VAT marża;
- VAT-RR.
Serwis nie zapewnia również:
- możliwości rozliczania podatku dochodowego wspólników z uwzględnieniem dokonanej zmiany udziałów w zysku poszczególnych wspólników w trakcie roku podatkowego;
- wyliczenia zaliczki na podatek dochodowy dla wielu źródeł przychodów;
- możliwości samodzielnego naliczania płac;
- rozliczania Użytkowników będących rolnikami ryczałtowymi;
- rozliczania Użytkowników rozliczających się z podatku VAT na zasadzie marży;
- automatycznego naliczania innych składek niż wymienionych w artykule Automatyczne wyliczanie składek ZUS.
Wszystkie pomysły na nowe funkcjonalności można zgłaszać na forum - Pomysły na nowe funkcjonalności.